Innbyggere i Sør-Sudan har muligheten til å ta høyere utdanning i enten et universitet eller en yrkesskole. Selv om det er en mangel på begge institusjoner, flere programmer er på plass for å utvide dagens landskapet i høyere utdanning i Sør-Sudan.

Akademiske institusjoner rundt om i verden har en BSc eller Bachelor of Science. Denne populære lavere grad er nyttig i å forberede studentene på arbeidsplassen eller for avanserte studieprogrammene. Den gjennomsnittlige BSc tar tre til fem år å fullføre.